IL-7–dependent and –independent lineages of IL-7R–dependent human T cells - Laboratoire Chrono Environnement (UMR 6249)
Article Dans Une Revue The Journal of clinical investigation Année : 2024

IL-7–dependent and –independent lineages of IL-7R–dependent human T cells

Carlos Arango-Franco (1, 2, 3) , Masato Ogishi (4) , Susanne Unger (5) , Ottavia Delmonte (6) , Julio César Orrego (3) , Ahmad Yatim (6) , Margarita Velasquez-Lopera (3) , Andrés Zea-Vera (6, 7, 8) , Jonathan Bohlen (1, 2) , Marwa Chbihi (1, 2) , Antoine Fayand (1, 2) , Juan Pablo Sánchez (3) , Julian Rojas (3) , Yoann Seeleuthner (1, 2) , Tom Le Voyer (1, 2) , Quentin Philippot (1, 2) , Kathryn Payne (5) , Adrian Gervais (1, 2) , Lucia Erazo-Borrás (1, 2, 3) , Luis Correa-Londoño (3) , Axel Cederholm (9) , Alejandro Gallón-Duque (3) , Pedro Gonçalves (10) , Jean-Marc Doisne (10) , Liran Horev (11, 12) , Bénédicte Charmeteau-de Muylder (13) , Jesús Á. Álvarez (3) , Diana Arboleda (3) , Lizet Pérez-Zapata (3) , Estefanía Vásquez-Echeverri (3) , Marcela Moncada-Vélez (3, 4) , Juan López (3) , Yolanda Caicedo (14) , Boaz Palterer (6) , Pablo Patiño (3) , Carlos Montoya (3) , Matthieu Chaldebas (4) , Peng Zhang (1, 15, 4) , Tina Nguyen (16, 17) , Cindy Ma (16, 17) , Mohamed Jeljeli (18) , Juan Alzate (3) , Felipe Cabarcas (3) , Taushif Khan (19, 20) , Darawan Rinchai (4) , Jean-Luc Prétet (21, 22) , Bertrand Boisson (1, 2, 4) , Nico Marr (19, 20) , Ruba Ibrahim (11, 12) , Vered Molho-Pessach (11, 12) , Stéphanie Boisson-Dupuis (1, 2, 4) , Dimitra Kiritsi (23) , João Barata (24) , Nils Landegren (9) , Bénédicte Neven (25) , Laurent Abel (1, 2, 4) , Andrea Lisco (6) , Vivien Béziat (1, 2, 4) , Emmanuelle Jouanguy (1, 2, 4) , Jacinta Bustamante (1, 2, 4) , James Di Santo (10) , Stuart Tangye (16, 17) , Luigi Notarangelo (6) , Rémi Cheynier (13) , Ken Natsuga (26) , Andrés Arias (3, 4) , José Luis Franco (3) , Klaus Warnatz (5) , Jean-Laurent Casanova (1, 2, 4, 27) , Anne Puel (1, 2, 4)
1 Imagine - U1163 - Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
2 Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
3 Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
4 Rockefeller University [New York]
5 Albert-Ludwigs-Universität Freiburg = University of Freiburg
6 NIH - National Institutes of Health [Bethesda, MD, USA]
7 HUV - Hospital Universitario del Valle Evaristo García ESE [Cali, Colombia]
8 Univalle - Universidad del Valle [Cali]
9 Uppsala Universitet [Uppsala]
10 Immunité Innée - Innate Immunity
11 HUJ - The Hebrew University of Jerusalem
12 Hadassah Hebrew University Medical Center [Jerusalem]
13 IC UM3 (UMR 8104 / U1016) - Institut Cochin
14 CFCS - Clinica Farallones Christus Sinergia [Cali, Colombia]
15 INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151) - Institut Necker Enfants-Malades
16 Garvan Institute of medical research
17 UNSW - University of New South Wales [Sydney]
18 Hôpital Cochin [AP-HP]
19 Sidra Medicine [Doha, Qatar]
20 HBKU - Hamad Bin Khalifa University [Doha, Qatar]
21 LCE - Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249)
22 CHRU Besançon - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon
23 Uniklinik - Universitäts Klinikum Freiburg = University Medical Center Freiburg
24 ULISBOA - Universidade de Lisboa = University of Lisbon = Université de Lisbonne
25 Karolinska Institute
26 Hokkaido University [Sapporo, Japan]
27 HHMI - Howard Hughes Medical Institute
Carlos Arango-Franco
  • Fonction : Auteur
Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Masato Ogishi
Rockefeller University [New York]
Susanne Unger
  • Fonction : Auteur
Albert-Ludwigs-Universität Freiburg = University of Freiburg
Ottavia Delmonte
National Institutes of Health [Bethesda, MD, USA]
Julio César Orrego
  • Fonction : Auteur
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Ahmad Yatim
  • Fonction : Auteur
National Institutes of Health [Bethesda, MD, USA]
Margarita Velasquez-Lopera
  • Fonction : Auteur
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Andrés Zea-Vera
  • Fonction : Auteur
National Institutes of Health [Bethesda, MD, USA]
Hospital Universitario del Valle Evaristo García ESE [Cali, Colombia]
Universidad del Valle [Cali]
Jonathan Bohlen
  • Fonction : Auteur
Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Marwa Chbihi
  • Fonction : Auteur
Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Antoine Fayand
  • Fonction : Auteur
Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Juan Pablo Sánchez
  • Fonction : Auteur
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Julian Rojas
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Yoann Seeleuthner
  • Fonction : Auteur
Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Tom Le Voyer
Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Quentin Philippot
  • Fonction : Auteur
Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Kathryn Payne
Albert-Ludwigs-Universität Freiburg = University of Freiburg
Adrian Gervais
  • Fonction : Auteur
Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Lucia Erazo-Borrás
  • Fonction : Auteur
Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Luis Correa-Londoño
  • Fonction : Auteur
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Axel Cederholm
Uppsala Universitet [Uppsala]
Alejandro Gallón-Duque
  • Fonction : Auteur
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Pedro Gonçalves
Immunité Innée - Innate Immunity
Jean-Marc Doisne
Immunité Innée - Innate Immunity
Liran Horev
  • Fonction : Auteur
The Hebrew University of Jerusalem
Hadassah Hebrew University Medical Center [Jerusalem]
Bénédicte Charmeteau-de Muylder
  • Fonction : Auteur
Institut Cochin
Jesús Á. Álvarez
  • Fonction : Auteur
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Diana Arboleda
  • Fonction : Auteur
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Lizet Pérez-Zapata
  • Fonction : Auteur
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Estefanía Vásquez-Echeverri
  • Fonction : Auteur
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Marcela Moncada-Vélez
  • Fonction : Auteur
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Rockefeller University [New York]
Juan López
  • Fonction : Auteur
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Yolanda Caicedo
  • Fonction : Auteur
Clinica Farallones Christus Sinergia [Cali, Colombia]
Boaz Palterer
  • Fonction : Auteur
National Institutes of Health [Bethesda, MD, USA]
Pablo Patiño
  • Fonction : Auteur
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Carlos Montoya
  • Fonction : Auteur
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Matthieu Chaldebas
  • Fonction : Auteur
Rockefeller University [New York]
Peng Zhang
Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
Institut Necker Enfants-Malades
Rockefeller University [New York]
Tina Nguyen
  • Fonction : Auteur
Garvan Institute of medical research
University of New South Wales [Sydney]
Cindy Ma
Garvan Institute of medical research
University of New South Wales [Sydney]
Mohamed Jeljeli
  • Fonction : Auteur
Hôpital Cochin [AP-HP]
Juan Alzate
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Felipe Cabarcas
  • Fonction : Auteur
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Taushif Khan
Sidra Medicine [Doha, Qatar]
Hamad Bin Khalifa University [Doha, Qatar]
Darawan Rinchai
Rockefeller University [New York]
Jean-Luc Prétet
  • Fonction : Auteur
Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249)
Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon
Bertrand Boisson
Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Rockefeller University [New York]
Nico Marr
Sidra Medicine [Doha, Qatar]
Hamad Bin Khalifa University [Doha, Qatar]
Ruba Ibrahim
  • Fonction : Auteur
The Hebrew University of Jerusalem
Hadassah Hebrew University Medical Center [Jerusalem]
Vered Molho-Pessach
  • Fonction : Auteur
The Hebrew University of Jerusalem
Hadassah Hebrew University Medical Center [Jerusalem]
Stéphanie Boisson-Dupuis
  • Fonction : Auteur
Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Rockefeller University [New York]
Dimitra Kiritsi
Universitäts Klinikum Freiburg = University Medical Center Freiburg
João Barata
  • Fonction : Auteur
Universidade de Lisboa = University of Lisbon = Université de Lisbonne
Nils Landegren
  • Fonction : Auteur
Uppsala Universitet [Uppsala]
Bénédicte Neven
  • Fonction : Auteur
Karolinska Institute
Laurent Abel
Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Rockefeller University [New York]
Andrea Lisco
National Institutes of Health [Bethesda, MD, USA]
Vivien Béziat
Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Rockefeller University [New York]
Emmanuelle Jouanguy
  • Fonction : Auteur
Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Rockefeller University [New York]
Jacinta Bustamante
Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Rockefeller University [New York]
James Di Santo
Immunité Innée - Innate Immunity
Stuart Tangye
  • Fonction : Auteur
Garvan Institute of medical research
University of New South Wales [Sydney]
Luigi Notarangelo
National Institutes of Health [Bethesda, MD, USA]
Rémi Cheynier
  • Fonction : Auteur
Institut Cochin
Ken Natsuga
Hokkaido University [Sapporo, Japan]
Andrés Arias
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Rockefeller University [New York]
José Luis Franco
Universidad de Antioquia = University of Antioquia [Medellín, Colombia]
Klaus Warnatz
  • Fonction : Auteur
Albert-Ludwigs-Universität Freiburg = University of Freiburg
Jean-Laurent Casanova
  • Fonction : Auteur correspondant
  • PersonId : 867631

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Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Rockefeller University [New York]
Howard Hughes Medical Institute
Anne Puel
  • Fonction : Auteur correspondant
  • PersonId : 1039617

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Imagine - Institut des maladies génétiques (IHU)
Hôpital Necker - Enfants Malades [AP-HP]
Rockefeller University [New York]

Résumé

Infants with biallelic IL7R loss-of-function variants have severe combined immune deficiency (SCID) characterized by the absence of autologous T lymphocytes, but normal counts of circulating B and NK cells (T-B+NK+ SCID). We report 6 adults (aged 22 to 59 years) from 4 kindreds and 3 ancestries (Colombian, Israeli Arab, Japanese) carrying homozygous IL7 loss-of-function variants resulting in combined immunodeficiency (CID). Deep immunophenotyping revealed relatively normal counts and/or proportions of myeloid, B, NK, and innate lymphoid cells. By contrast, the patients had profound T cell lymphopenia, with low proportions of innate-like adaptive mucosal-associated invariant T and invariant NK T cells. They also had low blood counts of T cell receptor (TCR) excision circles, recent thymic emigrant T cells and naive CD4+ T cells, and low overall TCR repertoire diversity, collectively indicating impaired thymic output. The proportions of effector memory CD4+ and CD8+ T cells were high, indicating IL-7-independent homeostatic T cell proliferation in the periphery. Intriguingly, the proportions of other T cell subsets, including TCRγδ+ T cells and some TCRαβ+ T cell subsets (including Th1, Tfh, and Treg) were little affected. Peripheral CD4+ T cells displayed poor proliferation, but normal cytokine production upon stimulation with mitogens in vitro. Thus, inherited IL-7 deficiency impairs T cell development less severely and in a more subset-specific manner than IL-7R deficiency. These findings suggest that another IL-7R-binding cytokine, possibly thymic stromal lymphopoietin, governs an IL-7-independent pathway of human T cell development.

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Carlos Arango-Franco, Masato Ogishi, Susanne Unger, Ottavia Delmonte, Julio César Orrego, et al.. IL-7–dependent and –independent lineages of IL-7R–dependent human T cells. The Journal of clinical investigation, 2024, 134 (19), pp.e180251. ⟨10.1172/JCI180251⟩. ⟨hal-04752101⟩

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