Signatures métabolomiques et transcriptomiques de l’immunité antivirale chez Ostreococcus mediterraneus - Laboratoire de Biodiversité et Biotechnologies Microbiennes Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2020

Metabolomic and transcriptomic signatures of antiviral immunity in Ostreococcus mediterraneus

Signatures métabolomiques et transcriptomiques de l’immunité antivirale chez Ostreococcus mediterraneus

Résumé

Ostreococcus mediterraneus is a picoeukaryotic phytoplankton (microalgae) at the base of coastal marine food webs. This phytoplankton is subject to viral attacks from large nucleocytoplasmic DNA viruses of the genus Prasinovirus, of which the Ostreococcus mediterraneus Virus 2 (OmV2) strain is a member. Within populations of microalgae sensitive to the virus, the spontaneous emergence of resistant immune phenotypes has been observed. The genetic basis of this resistance has recently been described in Ostreococcus: they seem to be carried by an atypical immune chromosome called SOC (Small Outlier Chromosome). In this context, we sought to characterize the metabolomic and transcriptomic signatures of this immunity through an approach that aims to correlate these two levels of expression. Biomarker metabolites and genes associated with the immune profiles have been identified. These data were put into perspective with the results of the metabolomic analysis of the virus in order to identify the metabolic pathways hijacked by the virus during infection.
Ostreococcus mediterraneus est un phytoplancton (microalgue) picoeucaryote à la base des réseaux trophiques marins côtiers. Ce phytoplancton est soumis à des attaques virales de grands virus nucléocytoplasmiques à ADN du genre Prasinovirus dont la souche Ostreococcus mediterraneus Virus 2 (OmV2) fait partie. Au sein de populations de microalgues sensibles au virus il a été observé l’émergence spontanée de phénotypes immunitaires résistants. Les bases génétiques de cette résistance ont récemment été décrites chez Ostreococcus : elles semblent véhiculées par un chromosome immunitaire atypique appelé SOC (Small Outlier Chromosome). Dans ce contexte nous avons cherché à caractériser les signatures métabolomiques et transcriptomiques de cette immunité au travers d’une approche visant à corréler ces deux niveaux d’expression. Des métabolites lipidiques biomarqueurs (galactolipides, phytostérols, sphingolipides) de chaque profil immunitaire ainsi que les gènes associés à leur métabolisme ont été identifiés. Ces données ont été mis en perspective des résultats de l’analyse métabolomique du virus afin d’identifier des voies métaboliques sollicitées et détournées par le virus lors de l’infection.
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Citer

Rémy Marcellin-Gros. Signatures métabolomiques et transcriptomiques de l’immunité antivirale chez Ostreococcus mediterraneus. Chimie. Sorbonne Université, 2020. Français. ⟨NNT : 2020SORUS131⟩. ⟨tel-03945792⟩
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