The genome of Theobroma cacao. - Laboratoire des Interactions Plantes Microbes Environnement Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Nature Genetics Année : 2011

The genome of Theobroma cacao.

Xavier Argout
  • Fonction : Auteur
Jean-Marc Aury
Mark J Guiltinan
  • Fonction : Auteur
Gaetan Droc
Mathilde Allegre
  • Fonction : Auteur
Thierry Legavre
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Siela N Maximova
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Florent Murat
Olivier Fouet
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Yolande Roguet
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Maguy Rodier-Goud
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Jose Fernandes Barbosa-Neto
  • Fonction : Auteur
Jetty Siva S Ammiraju
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Stephan C Schuster
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John E Carlson
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Erika Sallet
Laura Gelley
  • Fonction : Auteur
Zi Shi
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Christopher Viot
Michel Boccara
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Xavier Sabau
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Michael J Axtell
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Zhaorong Ma
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Yufan Zhang
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Xiang Song
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Didier Clement
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Mathias Tahi
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Joseph Moroh Akaza
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Bertrand Pitollat
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Karina Gramacho
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Diogenes Infante
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Ismael Kebe
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Rod Wing
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Francis Quetier
Stephanie Bocs
Claire Lanaud
  • Fonction : Auteur

Résumé

We sequenced and assembled the draft genome of Theobroma cacao, an economically important tropical-fruit tree crop that is the source of chocolate. This assembly corresponds to 76% of the estimated genome size and contains almost all previously described genes, with 82% of these genes anchored on the 10 T. cacao chromosomes. Analysis of this sequence information highlighted specific expansion of some gene families during evolution, for example, flavonoid-related genes. It also provides a major source of candidate genes for T. cacao improvement. Based on the inferred paleohistory of the T. cacao genome, we propose an evolutionary scenario whereby the ten T. cacao chromosomes were shaped from an ancestor through eleven chromosome fusions.

Dates et versions

hal-00855922 , version 1 (30-08-2013)

Identifiants

Citer

Xavier Argout, Jerome Salse, Jean-Marc Aury, Mark J Guiltinan, Gaetan Droc, et al.. The genome of Theobroma cacao.. Nature Genetics, 2011, 43 (2), pp.101-8. ⟨10.1038/ng.736⟩. ⟨hal-00855922⟩
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