The ProDom database of protein domain families: more emphasis on 3D - Laboratoire des Interactions Plantes Microbes Environnement Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Nucleic Acids Research Année : 2005

The ProDom database of protein domain families: more emphasis on 3D

Catherine Bru
  • Fonction : Auteur
Emmanuel Courcelle
  • Fonction : Auteur
Sébastien Carrère
Yoann Beausse
  • Fonction : Auteur
Sandrine Dalmar
  • Fonction : Auteur

Résumé

ProDom is a comprehensive database of protein domain families generated from the global comparison of all available protein sequences. Recent improvements include the use of three-dimensional (3D) information from the SCOP database; a completely redesigned web interface (http://www.toulouse.inra.fr/prodom.html); visualization of ProDom domains on 3D structures; coupling of ProDom analysis with the Geno3D homology modelling server; Bayesian inference of evolutionary scenarios for ProDom families. In addition, we have developed ProDom-SG, a ProDom-based server dedicated to the selection of candidate proteins for structural genomics.

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hal-01214150 , version 1 (09-10-2015)

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Citer

Catherine Bru, Emmanuel Courcelle, Sébastien Carrère, Yoann Beausse, Sandrine Dalmar, et al.. The ProDom database of protein domain families: more emphasis on 3D. Nucleic Acids Research, 2005, 33 (Database issue), pp.D212-D215. ⟨10.1093/nar/gki034⟩. ⟨hal-01214150⟩
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