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Bienvenue sur la collection MicroScope, vous y trouverez les publications scientifiques qui ont utilisé la plate-forme MicroScope

MicroScope membre des infrastructures IFB et France Génomique est la plate-forme d'annotation et d'analyse du génome microbien du LABGeM - CEA/Genoscope sous la tutelle CEA, CNRS et Université Evry Val de Seine

Les différentes activités de la plate-forme MicroScope sont : L'innovation de génomes microbiens (génomes et métagénomes assemblés) et développement d'outils destinés à l'annotation, à la génomique et au métabolisme comparatifs de génomes bactériens; la génomique comparative et pangénomique; la prédiction de fonction et de processus biologiques; la reconstruction de réseaux métaboliques; l'analyse de données de transcriptonique; l'assistance techniques; la formation à l'annotation de génomes procaryotes et à la curation de réseaux métaboliques.

COLLABORATION INTERNATIONALE

 

 Pour toute question : hal@cea.fr

 

NOMBRE DE TEXTES INTEGRAUX

222

NOMBRE DE NOTICES

72

INDICATEUR D'OPEN ACCESS

87 %

MOTS CLES

Symbiosis Coevolution Aquaculture Fitness cost Biodiversity Actinorhizal symbiosis Clostridioides difficile DDDH Flavobacterium psychrophilum Directed evolution Acinetobacter baumannii Adaptation Nitrification Molecular evolution Magnetotactic bacteria Lactic acid bacteria Pathogenicity Genome-scale metabolic networks Oxidative stress Dichloromethane Mineral weathering Alkaline thermal spring Fish pathogen Polyphasic taxonomy Magnetotaxis Nitrogen fixing HGT Metagenomics Acid mine drainage AMD Marine bacteria Gut microbiota Experimental evolution ESBL Activated sludge Genome mining Metabolomics CTX-M-15 Comparative genomics Fish-pathogenic bacteria Virulence Archaea Arsenic Complete genome Thermophile Genomics Heavy metal resistance Genome sequence Secondary metabolites Microbiology Evolution Insect Proteomics Continuous culture Digital DNA-DNA hybridization Phylogeny ACL Formate assimilation Escherichia coli Dehalogenation Genome Bacteriophage Transcriptome Mobile genetic elements Microbial genomics Bactérie Brochothrix thermosphacta Cyanobacteria Functional genomics Bacterial Pangenome Genome evolution Genomes Betaproteobacteria Bacteriocin Average nucleotide identity Legume-rhizobium symbiosis Agrobacterium tumefaciens Metabolism Fish pathogens Bioremediation Iron uptake Anaerobic Transcriptomics Natural products Horizontal gene transfer Food Bacteroidetes Gene regulation Flavobacteriaceae Metabolic networks Virulence factors Lactobacillus Functional annotation Bacterial genetics Hydrothermal Bacteria Holobiont Biofilm Rhizobium Nitrogen fixation