Genomic analyses inform on migration events during the peopling of Eurasia - CNRS - Centre national de la recherche scientifique Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Nature Année : 2016

Genomic analyses inform on migration events during the peopling of Eurasia

Luca Pagani , Daniel John Lawson , Evelyn Jagoda , Alexander Mörseburg , Anders Abdullah , Mari Mitt , Florian Clemente , Georgi Hudjashov , Michael Degiorgio , Lauri Saag , Jeffrey Wall , Alexia Cardona , Reedik Mägi , Melissa Wilson Sayres , Sarah Kaewert , Charlotte Inchley , Chris Scheib , Mari Järve , Monika Karmin , Guy Jacobs , Tiago Antao , Florin Mircea Iliescu , Alena Kushniarevich , Qasim Ayub , Chris Tyler-Smith (1) , Yali Xue (2) , Bayazit Yunusbayev , Kristiina Tambets , Chandana Basu Mallick , Lehti Saag , Elvira Pocheshkhova , George Andriadze , Craig Muller , Michael Westaway , David Lambert , Grigor Zoraqi , Shahlo Turdikulova , Dilbar Dalimova , Zhaxylyk Sabitov , Gazi Nurun Nahar Sultana , Joseph Lachance , Sarah Tishkoff (3) , Kuvat Momynaliev , Jainagul Isakova (4) , Larisa Damba , Marina Gubina , Pagbajabyn Nymadawa (5) , Irina Evseeva (6) , Lubov Atramentova , Olga Utevska , Francois-Xavier Ricaut (7) , Nicolas Brucato (7) , Herawati Sudoyo , Thierry Letellier (8) , Murray Cox , Nikolay Barashkov , Vedrana Skaro , Lejla Mulahasanovic , Dragan Primorac , Hovhannes Sahakyan , Maru Mormina (9) , Christina Eichstaedt , Daria Lichman , Syafiq Abdullah , Gyaneshwer Chaubey , Joseph Wee , Evelin Mihailov , Alexandra Karunas , Sergei Litvinov , Rita Khusainova , Natalya Ekomasova , Vita Akhmetova , Irina Khidiyatova , Damir Marjanović , Levon Yepiskoposyan , Doron Behar , Elena Balanovska , Andres Metspalu (10) , Miroslava Derenko , Boris Malyarchuk , Mikhail Voevoda , Sardana Fedorova , Ludmila Osipova (11) , Marta Mirazón Lahr , Pascale Gerbault , Matthew Leavesley , Andrea Migliano , Michael D Petraglia (12) , Oleg Balanovsky (13) , Elza K. Khusnutdinova (14) , Ene Metspalu (15) , Mark Thomas , Andrea Manica , Rasmus Nielsen (16) , Richard Villems (17) , Eske Willerslev (18) , Toomas Kivisild (9) , Mait Metspalu (15) , Anders Eriksson (19) , Mario Mitt , Melissa Sayres , Christiana Scheib , Mari Gubina , Vedrana Škaro , Lejla Mulahasanovic´ , Chris Eichstaedt , Andrea Bamberg Migliano
Luca Pagani
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Daniel John Lawson
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Evelyn Jagoda
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Alexander Mörseburg
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Anders Abdullah
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Mari Mitt
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Florian Clemente
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Georgi Hudjashov
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Michael Degiorgio
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Lauri Saag
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Reedik Mägi
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Melissa Wilson Sayres
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Sarah Kaewert
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Mari Järve
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Guy Jacobs
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Florin Mircea Iliescu
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Alena Kushniarevich
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Chris Tyler-Smith
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Yali Xue
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Bayazit Yunusbayev
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Résumé

High-coverage whole-genome sequence studies have so far focused on a limited number of geographically restricted populations, or been targeted at specific diseases, such as cancer. Nevertheless, the availability of high-resolution genomic data has led to the development of new methodologies for inferring population history and refuelled the debate on the mutation rate in humans. Here we present the Estonian Biocentre Human Genome Diversity Panel (EGDP), a dataset of 483 high-coverage human genomes from 148 populations worldwide, including 379 new genomes from 125 populations, which we group into diversity and selection sets. We analyse this dataset to refine estimates of continent-wide patterns of heterozygosity, long- and short-distance gene flow, archaic admixture, and changes in effective population size through time as well as for signals of positive or balancing selection. We find a genetic signature in present-day Papuans that suggests that at least 2% of their genome originates from an early and largely extinct expansion of anatomically modern humans (AMHs) out of Africa. Together with evidence from the western Asian fossil record, and admixture between AMHs and Neanderthals predating the main Eurasian expansion, our results contribute to the mounting evidence for the presence of AMHs out of Africa earlier than 75,000 years ago.

Dates et versions

hal-02112768 , version 1 (26-04-2019)

Identifiants

Citer

Luca Pagani, Daniel John Lawson, Evelyn Jagoda, Alexander Mörseburg, Anders Abdullah, et al.. Genomic analyses inform on migration events during the peopling of Eurasia. Nature, 2016, 538 (7624), pp.238-242. ⟨10.1038/nature19792⟩. ⟨hal-02112768⟩

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