The genome of Eucalyptus grandis - CNRS - Centre national de la recherche scientifique Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Nature Année : 2014

The genome of Eucalyptus grandis

Alexander Myburg , Dario Grattapaglia , Gerald Tuskan (1) , Uffe Hellsten (2) , Richard Hayes (3) , Jane Grimwood (4) , Jerry Jenkins (5) , Erika Lindquist (4) , Hope Tice (6) , Diane Bauer , David Goodstein (4) , Inna Dubchak (4) , Alexandre Poliakov , Eshchar Mizrachi , Anand Kullan , Steven Hussey , Desre Pinard , Karen van Der Merwe , Pooja Singh , Ida van Jaarsveld , Orzenil Silva-Junior , Roberto Togawa (7) , Marilia Pappas , Danielle Faria , Carolina Sansaloni , Cesar Petroli , Xiaohan Yang (1) , Priya Ranjan (1) , Timothy Tschaplinski , Chu-Yu Ye (1) , Ting Li (8) , Lieven Sterck (9) , Kevin Vanneste (10) , Florent Murat (11) , Marçal Soler (12) , Hélène San Clemente (12) , Naijib Saidi , Hua Cassan-Wang (13) , Christophe Dunand (14) , Charles Hefer , Erich Bornberg-Bauer (15) , Anna Kersting (16) , Kelly Vining , Vindhya Amarasinghe , Martin Ranik , Sushma Naithani , Justin Elser , Alexander Boyd , Aaron Liston , Joseph Spatafora (17) , Palitha Dharmwardhana , Rajani Raja , Christopher Sullivan , Elisson Romanel , Marcio Alves-Ferreira , Carsten Külheim , William Foley , Víctor Carocha (18) , Jorge Paiva (19) , David Kudrna (20) , Sergio Brommonschenkel , Giancarlo Pasquali , Margaret Byrne , Philippe Rigault (21) , Josquin Tibbits (22) , Antanas Spokevicius , Rebecca Jones , Dorothy Steane , René Vaillancourt , Brad Potts , Fourie Joubert (23) , Kerrie Barry (5) , Georgios Pappas (24) , Steven Strauss , Pankaj Jaiswal (25) , Jacqueline Grima Pettenati (13) , Jérôme Salse (11) , Yves van de Peer (9) , Daniel Rokhsar (2) , Jeremy Schmutz (5)
Alexander Myburg
  • Fonction : Auteur
Dario Grattapaglia
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Diane Bauer
  • Fonction : Auteur
Alexandre Poliakov
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Eshchar Mizrachi
  • Fonction : Auteur
Anand Kullan
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Steven Hussey
Desre Pinard
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Karen van Der Merwe
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Pooja Singh
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Ida van Jaarsveld
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Orzenil Silva-Junior
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Marilia Pappas
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Danielle Faria
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Carolina Sansaloni
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Cesar Petroli
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Timothy Tschaplinski
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Lieven Sterck
Naijib Saidi
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Charles Hefer
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Kelly Vining
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Vindhya Amarasinghe
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Martin Ranik
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Sushma Naithani
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Justin Elser
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Alexander Boyd
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Aaron Liston
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Palitha Dharmwardhana
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Rajani Raja
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Christopher Sullivan
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Elisson Romanel
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Marcio Alves-Ferreira
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Carsten Külheim
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William Foley
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Sergio Brommonschenkel
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Giancarlo Pasquali
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Margaret Byrne
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Philippe Rigault
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Antanas Spokevicius
Rebecca Jones
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Dorothy Steane
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René Vaillancourt
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Brad Potts
  • Fonction : Auteur
Kerrie Barry
Steven Strauss
  • Fonction : Auteur
Yves van de Peer

Résumé

Eucalypts are the world's most widely planted hardwood trees. Their outstanding diversity, adaptability and growth have made them a global renewable resource of fibre and energy. We sequenced and assembled >94% of the 640-megabase genome of Eucalyptus grandis. Of 36,376 predicted protein-coding genes, 34% occur in tandem duplications, the largest proportion thus far in plant genomes. Eucalyptus also shows the highest diversity of genes for specialized metabolites such as terpenes that act as chemical defence and provide unique pharmaceutical oils. Genome sequencing of the E. grandis sister species E. globulus and a set of inbred E. grandis tree genomes reveals dynamic genome evolution and hotspots of inbreeding depression. The E. grandis genome is the first reference for the eudicot order Myrtales and is placed here sister to the eurosids. This resource expands our understanding of the unique biology of large woody perennials and provides a powerful tool to accelerate comparative biology, breeding and biotechnology.
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Citer

Alexander Myburg, Dario Grattapaglia, Gerald Tuskan, Uffe Hellsten, Richard Hayes, et al.. The genome of Eucalyptus grandis. Nature, 2014, 510 (7505), pp.356-362. ⟨10.1038/nature13308⟩. ⟨hal-02285478⟩
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