A reference map of the human protein interactome - CNRS - Centre national de la recherche scientifique Accéder directement au contenu
Pré-Publication, Document De Travail Nature Année : 2020

A reference map of the human protein interactome

Katja Luck (1, 2) , Dae-Kyum Kim (1, 3) , Luke Lambourne (1, 2) , Kerstin Spirohn (1, 2) , Bridget E Begg (1, 2) , Wenting Bian (1, 2) , Ruth Brignall (1, 2) , Tiziana Cafarelli (1, 2) , Francisco J Campos-Laborie (4) , Benoit Charloteaux (1, 2) , Dongsic Choi (5) , Atina G Cote (1, 3, 6) , Meaghan Daley (1, 2) , Steven Deimling (3) , Alice Desbuleux (1, 2, 7) , Amélie Dricot (1, 2) , Marinella Gebbia (1, 3, 6) , Madeleine F Hardy (1, 2) , Nishka Kishore (1, 3, 6) , Jennifer J Knapp (1, 3, 6) , István A. Kovács (8, 1, 9) , Irma Lemmens (10, 11) , Miles W. Mee (3) , Joseph C Mellor (3, 1, 6) , Carl Pollis (1, 2) , Carles Pons (12) , Aaron D Richardson (1, 2) , Sadie Schlabach (1, 2) , Bridget Teeking (1, 2) , Anupama Yadav (1, 2) , Mariana Babor (1, 3, 6) , Dawit Balcha (1, 2) , Omer Basha (13) , Christian Bowman-Colin (2) , Suet-Feung Chin (14) , Soon Gang Choi (1, 2) , Claudia Colabella (15) , Georges Coppin (1, 2) , Cassandra d'Amata (3) , David de Ridder (1, 2) , Steffi de Rouck (10, 11) , Miquel Duran-Frigola (12) , Hanane Ennajdaoui (1, 3, 6) , Florian Goebels (3) , Liana Goehring (2) , Anjali Gopal (1, 3, 6) , Ghazal Haddad (1, 3, 6) , Elodie Hatchi (2, 1) , Mohamed Helmy (3) , Yves Jacob (16) , Yoseph Kassa (1, 2) , Serena Landini (2) , Roujia Li (1, 3, 6) , Natascha van Lieshout , Andrew Macwilliams , Dylan Markey , Joseph N Paulson , Sudharshan Rangarajan , John Rasla , Ashyad Rayhan , Thomas Rolland (1, 2) , Adriana San-Miguel , Yun Shen , Dayag Sheykhkarimli , Gloria M Sheynkman , Eyal Simonovsky , Murat Taşan , Alexander Tejeda , Jean-Claude Twizere , Yang Wang , Robert J Weatheritt , Jochen Weile , Yu Xia , Xinping Yang , Esti Yeger-Lotem , Quan Zhong , Patrick Aloy , Gary D Bader , Javier de Las Rivas (4) , Suzanne Gaudet (1, 2) , Tong Hao (1, 2) , Janusz Rak (5) , Jan Tavernier (10, 11) , Vincent Tropepe (3) , David E Hill (1, 2) , Marc Vidal (1, 2) , Frederick P Roth (1, 3, 6, 17) , Michael A Calderwood (1, 2)
Suet-Feung Chin
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 925265
Natascha van Lieshout
  • Fonction : Auteur
Andrew Macwilliams
  • Fonction : Auteur
Dylan Markey
  • Fonction : Auteur
Joseph N Paulson
  • Fonction : Auteur
Sudharshan Rangarajan
  • Fonction : Auteur
John Rasla
  • Fonction : Auteur
Ashyad Rayhan
  • Fonction : Auteur
Adriana San-Miguel
  • Fonction : Auteur
Yun Shen
  • Fonction : Auteur
Dayag Sheykhkarimli
  • Fonction : Auteur
Gloria M Sheynkman
  • Fonction : Auteur
Eyal Simonovsky
  • Fonction : Auteur
Murat Taşan
  • Fonction : Auteur
Alexander Tejeda
  • Fonction : Auteur
Jean-Claude Twizere
Yang Wang
Robert J Weatheritt
  • Fonction : Auteur
Jochen Weile
  • Fonction : Auteur
Yu Xia
Xinping Yang
  • Fonction : Auteur
Esti Yeger-Lotem
Quan Zhong
  • Fonction : Auteur
Patrick Aloy
  • Fonction : Auteur
Gary D Bader

Résumé

Global insights into cellular organization and function require comprehensive understanding of interactome networks. Similar to how a reference genome sequence revolutionized human genetics, a reference map of the human interactome network is critical to fully understand genotype-phenotype relationships. Here we present the first human “all-by-all” binary reference interactome map, or “HuRI”. With ~53,000 high-quality protein-protein interactions (PPIs), HuRI is approximately four times larger than the information curated from small-scale studies available in the literature. Integrating HuRI with genome, transcriptome and proteome data enables the study of cellular function within essentially any physiological or pathological cellular context. We demonstrate the use of HuRI in identifying specific subcellular roles of PPIs and protein function modulation via splicing during brain development. Inferred tissue-specific networks reveal general principles for the formation of cellular context-specific functions and elucidate potential molecular mechanisms underlying tissue-specific phenotypes of Mendelian diseases. HuRI thus represents an unprecedented, systematic reference linking genomic variation to phenotypic outcomes.
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hal-02347978 , version 1 (08-11-2019)

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Paternité - Pas d'utilisation commerciale - Pas de modification

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Citer

Katja Luck, Dae-Kyum Kim, Luke Lambourne, Kerstin Spirohn, Bridget E Begg, et al.. A reference map of the human protein interactome. 2019. ⟨hal-02347978⟩

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