Diagnostic de la résistance non liée à la cible chez les ray grass (<em>Lolium</em> sp.) : développement de tests rapides et fiables - CNRS - Centre national de la recherche scientifique Accéder directement au contenu
Communication Dans Un Congrès Année : 2013

Diagnosis of non target site based resistance within rye grass(Lolium sp): development of quick and reliable tests

Diagnostic de la résistance non liée à la cible chez les ray grass (Lolium sp.) : développement de tests rapides et fiables

Résumé

Non target site resistance (NTSR) is the major threat for effective herbicide-based control of grass weeds. NTSR, still largely unknown, is endowed by the regulation of a subset of the genes involved in the response of the weed to herbicide treatment. This study aims at identifying NTSR genes in rye-grass to develop resistance diagnosis tests. The transcriptome of plants resistant or sensitive to ALS inhibitors collected before and after herbicide application was sequenced using a deep sequencing technology. We identified genes differentially expressed between resistant and sensitive plants. We developed a RT-qPCR test to measure gene expression levels in individual plants from several populations. Substantial, significant differences in gene expression occur between resistant and sensitive plants, which is a stumbling block when trying to identify NTSR genes.
La résistance non liée à la cible (RNLC) est la menace principale pour le contrôle chimique des graminées adventices. Ses mécanismes, encore très largement inconnus, sont basés sur la régulation d’une partie des gènes impliqués dans la réponse de la mauvaise herbe au traitement herbicide. Cette étude vise à identifier des gènes de RNLC chez les ray-grass afin de développer des tests « ADN » de diagnostic. Nous avons séquencé et assemblé le transcriptome de plantes résistantes ou sensibles à des inhibiteurs de l’ALS en présence et en l’absence de ces herbicides, puis nous avons identifié des gènes montrant une forte différence d’expression entre plantes résistantes et sensibles. Enfin, nous avons mis au point un test de RT-qPCR pour vérifier le niveau d’expression de ces gènes dans les plantes de ray-grass. Des différences d’expression substantielles et significatives existent entre plantes résistantes et sensibles, mais la variabilité d’expression entre plantes et entre populations est un obstacle à l’identification de gènes de RNLC.
Fichier non déposé

Dates et versions

hal-02746199 , version 1 (03-06-2020)

Identifiants

  • HAL Id : hal-02746199 , version 1
  • PRODINRA : 261552

Citer

Arnaud Duhoux, Jerome Gouzy, Sébastien Carrère, L. Bonin, Christophe Délye. Diagnostic de la résistance non liée à la cible chez les ray grass (Lolium sp.) : développement de tests rapides et fiables. 22. Conférence du Columa, Journées internationales sur la lutte contre les mauvaises herbes, Association Française de Protection des Plantes (AFPP). FRA., Dec 2013, Dijon, France. 45 p. ⟨hal-02746199⟩
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