Connecting the data landscape of long‐term ecological studies: the SPI‐Birds data hub - CNRS - Centre national de la recherche scientifique Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Journal of Animal Ecology Année : 2021

Connecting the data landscape of long‐term ecological studies: the SPI‐Birds data hub

Antica Culina (1) , Frank Adriaensen (2) , Liam Bailey (1, 3) , Malcolm Burgess (4) , Anne Charmantier (5) , Ella Cole (6) , Tapio Eeva (7) , Erik Matthysen (2) , Chloé Nater (8) , Ben Sheldon (6) , Bernt‐erik Sæther , Stefan J.G. Vriend , Zuzana Zajkova , Peter Adamík , Lucy Aplin , Elena Angulo , Alexandr Artemyev , Emilio Barba , Sanja Barišić , Eduardo Belda , C. Can Bilgin , Josefa Bleu (9) , Christiaan Both , Sandra Bouwhuis , Claire Branston , Juli Broggi , Terry Burke , Andrey Bushuev , Carlos Camacho , Daniela Campobello , David Canal , Alejandro Cantarero , Samuel Caro (5) , Maxime Cauchoix (10) , Alexis Chaine (10) , Mariusz Cichoń , Davor Ćiković , Camillo Cusimano , Caroline Deimel , André Dhondt , Niels Dingemanse , Blandine Doligez , Davide Dominoni , Claire Doutrelant (5) , Szymon Drobniak , Anna Dubiec , Marcel Eens , Kjell Einar Erikstad , Silvia Espín , Damien Farine , Jordi Figuerola , Pinar Kavak Gülbeyaz , Arnaud Grégoire (5) , Ian Hartley , Michaela Hau , Gergely Hegyi , Sabine Hille , Camilla Hinde , Benedikt Holtmann , Tatyana Ilyina , Caroline Isaksson , Arne Iserbyt , Elena Ivankina , Wojciech Kania , Bart Kempenaers , Anvar Kerimov , Jan Komdeur , Peter Korsten , Miroslav Král , Miloš Krist , Marcel Lambrechts (5) , Carlos Lara , Agu Leivits , András Liker , Jaanis Lodjak , Marko Mägi , Mark Mainwaring , Raivo Mänd , Bruno Massa , Sylvie Massemin (9) , Jesús Martínez‐padilla , Tomasz Mazgajski , Adele Mennerat , Juan Moreno , Alexia Mouchet , Shinichi Nakagawa , Jan‐åke Nilsson , Johan Nilsson , Ana Cláudia Norte , Kees Van Oers , Markku Orell , Jaime Potti , John Quinn , Denis Réale , Tone Kristin Reiertsen , Balázs Rosivall , Andrew Russel , Seppo Rytkönen , Pablo Sánchez‐virosta , Eduardo S.A. Santos , Julia Schroeder , Juan Carlos Senar , Gábor Seress , Tore Slagsvold , Marta Szulkin , Céline Teplitsky (5) , Vallo Tilgar , Andrey Tolstoguzov , János Török , Mihai Valcu , Emma Vatka , Simon Verhulst , Marcel Visser , Hannah Watson , Teru Yuta , José Zamora‐marín
Ella Cole
  • Fonction : Auteur
Tapio Eeva
  • Fonction : Auteur
Chloé Nater
Ben Sheldon
  • Fonction : Auteur
Bernt‐erik Sæther
Stefan J.G. Vriend
  • Fonction : Auteur
Zuzana Zajkova
  • Fonction : Auteur
Peter Adamík
  • Fonction : Auteur
Lucy Aplin
  • Fonction : Auteur
Elena Angulo
Alexandr Artemyev
  • Fonction : Auteur
Emilio Barba
  • Fonction : Auteur
Sanja Barišić
  • Fonction : Auteur
Eduardo Belda
  • Fonction : Auteur
C. Can Bilgin
  • Fonction : Auteur
Josefa Bleu
Christiaan Both
  • Fonction : Auteur
Sandra Bouwhuis
Claire Branston
  • Fonction : Auteur
Juli Broggi
  • Fonction : Auteur
Terry Burke
  • Fonction : Auteur
Andrey Bushuev
  • Fonction : Auteur
Carlos Camacho
Daniela Campobello
  • Fonction : Auteur
David Canal
  • Fonction : Auteur
Alejandro Cantarero
Samuel Caro
Mariusz Cichoń
  • Fonction : Auteur
Davor Ćiković
  • Fonction : Auteur
Camillo Cusimano
  • Fonction : Auteur
Caroline Deimel
  • Fonction : Auteur
André Dhondt
  • Fonction : Auteur
Niels Dingemanse
  • Fonction : Auteur
Blandine Doligez
Davide Dominoni
Szymon Drobniak
  • Fonction : Auteur
Anna Dubiec
  • Fonction : Auteur
Marcel Eens
Kjell Einar Erikstad
  • Fonction : Auteur
Silvia Espín
  • Fonction : Auteur
Damien Farine
  • Fonction : Auteur
Jordi Figuerola
  • Fonction : Auteur
Pinar Kavak Gülbeyaz
  • Fonction : Auteur
Ian Hartley
  • Fonction : Auteur
Michaela Hau
  • Fonction : Auteur
Gergely Hegyi
  • Fonction : Auteur
Sabine Hille
  • Fonction : Auteur
Camilla Hinde
  • Fonction : Auteur
Benedikt Holtmann
  • Fonction : Auteur
Tatyana Ilyina
  • Fonction : Auteur
Caroline Isaksson
  • Fonction : Auteur
Arne Iserbyt
  • Fonction : Auteur
Elena Ivankina
  • Fonction : Auteur
Wojciech Kania
  • Fonction : Auteur
Bart Kempenaers
Anvar Kerimov
  • Fonction : Auteur
Jan Komdeur
  • Fonction : Auteur
Peter Korsten
  • Fonction : Auteur
Miroslav Král
  • Fonction : Auteur
Miloš Krist
  • Fonction : Auteur
Carlos Lara
  • Fonction : Auteur
Agu Leivits
  • Fonction : Auteur
András Liker
  • Fonction : Auteur
Jaanis Lodjak
  • Fonction : Auteur
Marko Mägi
  • Fonction : Auteur
Mark Mainwaring
  • Fonction : Auteur
Raivo Mänd
  • Fonction : Auteur
Bruno Massa
  • Fonction : Auteur
Jesús Martínez‐padilla
  • Fonction : Auteur
Tomasz Mazgajski
  • Fonction : Auteur
Adele Mennerat
Juan Moreno
  • Fonction : Auteur
Alexia Mouchet
  • Fonction : Auteur
Shinichi Nakagawa
  • Fonction : Auteur
Jan‐åke Nilsson
  • Fonction : Auteur
Johan Nilsson
  • Fonction : Auteur
Ana Cláudia Norte
  • Fonction : Auteur
Kees Van Oers
  • Fonction : Auteur
Markku Orell
  • Fonction : Auteur
Jaime Potti
  • Fonction : Auteur
John Quinn
  • Fonction : Auteur
Denis Réale
Tone Kristin Reiertsen
  • Fonction : Auteur
Balázs Rosivall
  • Fonction : Auteur
Andrew Russel
  • Fonction : Auteur
Seppo Rytkönen
  • Fonction : Auteur
Pablo Sánchez‐virosta
  • Fonction : Auteur
Eduardo S.A. Santos
  • Fonction : Auteur
Julia Schroeder
  • Fonction : Auteur
Juan Carlos Senar
Gábor Seress
  • Fonction : Auteur
Tore Slagsvold
  • Fonction : Auteur
Marta Szulkin
Vallo Tilgar
  • Fonction : Auteur
Andrey Tolstoguzov
  • Fonction : Auteur
János Török
  • Fonction : Auteur
Mihai Valcu
  • Fonction : Auteur
Emma Vatka
  • Fonction : Auteur
Simon Verhulst
Marcel Visser
Hannah Watson
  • Fonction : Auteur
Teru Yuta
  • Fonction : Auteur
José Zamora‐marín
  • Fonction : Auteur

Résumé

The integration and synthesis of the data in different areas of science is drastically slowed and hindered by a lack of standards and networking programmes. Long-term studies of individually marked animals are not an exception. These studies are especially important as instrumental for understanding evolutionary and ecological processes in the wild. Furthermore, their number and global distribution provides a unique opportunity to assess the generality of patterns and to address broad-scale global issues (e.g. climate change).To solve data integration issues and enable a new scale of ecological and evolutionary research based on long-term studies of birds, we have created the SPI-Birds Network and Database (www.spibirds.org)—a large-scale initiative that connects data from, and researchers working on, studies of wild populations of individually recognizable (usually ringed) birds. Within year and a half since the establishment, SPI-Birds has recruited over 120 members, and currently hosts data on almost 1.5 million individual birds collected in 80 populations over 2,000 cumulative years, and counting.SPI-Birds acts as a data hub and a catalogue of studied populations. It prevents data loss, secures easy data finding, use and integration and thus facilitates collaboration and synthesis. We provide community-derived data and meta-data standards and improve data integrity guided by the principles of Findable, Accessible, Interoperable and Reusable (FAIR), and aligned with the existing metadata languages (e.g. ecological meta-data language).The encouraging community involvement stems from SPI-Bird's decentralized approach: research groups retain full control over data use and their way of data management, while SPI-Birds creates tailored pipelines to convert each unique data format into a standard format. We outline the lessons learned, so that other communities (e.g. those working on other taxa) can adapt our successful model. Creating community-specific hubs (such as ours, COMADRE for animal demography, etc.) will aid much-needed large-scale ecological data integration.
Fichier principal
Vignette du fichier
Culina_etal_2020_JAE.pdf (1.9 Mo) Télécharger le fichier
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

hal-03035065 , version 1 (02-12-2020)

Identifiants

Citer

Antica Culina, Frank Adriaensen, Liam Bailey, Malcolm Burgess, Anne Charmantier, et al.. Connecting the data landscape of long‐term ecological studies: the SPI‐Birds data hub. Journal of Animal Ecology, 2021, 90 (9), pp.2147-2160. ⟨10.1111/1365-2656.13388⟩. ⟨hal-03035065⟩
140 Consultations
42 Téléchargements

Altmetric

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More