Oiseaux sauvages et virus West Nile : étude éco-épidémiologique en Camargue - CNRS - Centre national de la recherche scientifique Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2006

Wild birds and West Nile virus: eco-epidemiologic study in the Camargue

Oiseaux sauvages et virus West Nile : étude éco-épidémiologique en Camargue

Elsa Jourdain

Résumé

The work presented here deals with the role of wild birds in West Nile (WN) virus epidemiology in the Camargue. Bird species likely to be involved in the various steps of WN virus circulation (introduction, amplification, spread, emergence) are identified using bibliographic data on WN disease and ornithological criteria. Epidemiological investigations focused on some of these species during the years 2004 (epizootic year) and 2005 (post-epizootic year) show that WN virus is circulating in the Camargue bird population. Dates and locations of these contacts are unknown for migrating birds arriving from Africa in spring. Conversely, in sedentary birds, two isolates of a single strain were obtained in 2004, from the brain of a Common magpie Pica pica and a House sparrow Passer domesticus, respectively. They were totally sequenced. Phylogenetic analysis of this strain shows that it belongs to the same cluster as the other strains previously isolated in Mediterranean Europe. Serological and virological results in these two bird species, which are often seen in close proximity with horse farms, suggest that they are good candidates for WN virus amplification and emergence in horses. This hypothesis is also supported by the fact that viral RNA was found in the feces of a Common magpie in 2005. Investigations have to be pursued to assess how the various Camargue bird species are involved, respectively, in WN virus circulation. Other approaches should be used, like blood meal analysis of mosquito vectors, which were recently identified.
Le travail présenté ici s'intéresse au rôle des oiseaux sauvages dans l'épidémiologie du virus West Nile (WN) en Camargue. Des espèces d'oiseaux susceptibles d'intervenir dans les différentes phases de circulation du virus (introduction, amplification, dispersion, émergence) sont identifiées en s'appuyant sur les données bibliographiques relatives à la maladie et sur des critères ornithologiques. Les investigations épidémiologiques effectuées pour quelques unes de ces espèces en 2004 (année épizootique) et en 2005 (année post-épizootique) montrent que le virus WN circule dans la population d'oiseaux de Camargue. Pour les oiseaux migrateurs arrivant d'Afrique au printemps, les dates et lieux de ces contacts restent inconnus. Concernant les oiseaux sédentaires, deux isolats d'une même souche virale ont été obtenus en 2004, réciproquement à partir du cerveau d'une Pie bavarde Pica pica et d'un Moineau domestique Passer domesticus, et totalement séquencés. L'étude phylogénétique de cette souche montre qu'elle appartient au même cluster que celles précédemment isolées en Europe méditerranéenne. Les résultats sérologiques et virologiques chez ces deux espèces d'oiseaux, souvent observées à proximité des écuries, en font des candidates à l'amplification et l'émergence du virus WN chez les chevaux de Camargue. La mise en évidence, en 2005, d'ARN viral dans les fientes d'une Pie bavarde conforte cette hypothèse. Les recherches doivent se poursuivre pour évaluer la part respective des différents oiseaux de Camargue dans la circulation du virus WN en utilisant d'autres approches, comme par exemple l'analyse des repas de sang des moustiques vecteurs, récemment identifiés.
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Dates et versions

tel-00144110 , version 1 (30-04-2007)

Identifiants

  • HAL Id : tel-00144110 , version 1

Citer

Elsa Jourdain. Oiseaux sauvages et virus West Nile : étude éco-épidémiologique en Camargue. Ecologie, Environnement. Université Joseph-Fourier - Grenoble I, 2006. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-00144110⟩
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