Bacillus anthracis evolutionary history: taking advantage of polytomies and human history to propose dating points - I2BC Accéder directement au contenu
Communication Dans Un Congrès Année : 2019

Bacillus anthracis evolutionary history: taking advantage of polytomies and human history to propose dating points

Résumé

The document deposited here is a copy of the slides presented in support of my talk during the "Biology of Anthrax" meeting held in Bari, Italy (September 3 rd-6 th 2019). The talk was a synthesis and global analysis of our recent investigations taking advantage of the existence of rare remarkable features in the phylogeny of Bacillus anthracis, polytomies, to propose tentative dating points.
Le document déposé ici est une copie des diapositives que j'ai utilisées lors du congrès "Biology of Anthrax" (Bari, Italie, 3 au 6 septembre 2019). Bacillus anthracis est une espèce à évolution strictement clonale, ce qui permet de calculer des arbres phylogénétiques très robustes à partir des centaines de génomes complets disponibles. Mais du fait de la capacité de B. anthracis à sporuler, nous ne savons pas actuellement déduire de datation à partir de l'analyse des divergences génétiques. La présentation était une synthèse et une analyse globale de nos investigations récentes qui tirent parti de l'existence de radiations en étoile dans la structure de population de B. anthracis pour proposer des dates. Ces "polytomies" qui sont très rares coïncideraient avec des évènement historiques majeurs, tels que les conquêtes Mongoles au 13eme siècle. Ainsi l'analyse de la répartition géographique des souches constituant les différentes branches de ces polytomies permettrait d'en dater certaines. Les trois pages d'introduction aux diapositives fournissent en principe les éléments de contexte. Trois polytomies ont été étudiées. La présentation comporte deux hypothèses inédites et une prédiction. La première hypothèse est que l'expédition au Québec en 1665 du Régiment de Carignan-Salières a conduit à introduire le lignage de B. anthracis qui est actuellement largement prédominant en Amérique du Nord. La seconde est que les douze premiers chevaux parmi les environ 80 qui seront expédiés de France au Canada entre 1665 et 1671 et constitueront l'origine du "Cheval Canadien" ont été sélectionnés parmi les chevaux du régiment. Le régiment était un régiment d'infanterie, mais à cette époque, un régiment d'infanterie comptait quelques chevaux par compagnie. Le régiment aurait transporté le pathogène à son insu depuis son lieu de garnison (Marsal en Lorraine, région dans laquelle on trouve aujourd'hui les souches de B. anthracis les plus proches de souches d'Amérique du Nord et d'Afrique de l'Ouest) qu'il quitte en Janvier 1665 jusqu'au Québec atteint à l'été et automne 1665. Ce n'est pas la nourriture qui aura pu être porteuse de la contamination puisque le régiment achetait ses provisions à chaque étape de son déplacement en France. Le plus plausible serait alors une contamination d'équipements, voire même une contamination des chevaux qui auraient pu être porteurs sains. Cependant cette dernière option est actuellement encore loin d'être scientifiquement établie.
Vergnaud_dating_Bacillus_anthracis_evolution_Bari_Sept2019_with_slides.pdf (698.98 Ko) Télécharger le fichier
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

hal-02309307 , version 1 (09-10-2019)

Identifiants

  • HAL Id : hal-02309307 , version 1

Citer

Gilles Vergnaud. Bacillus anthracis evolutionary history: taking advantage of polytomies and human history to propose dating points. The biology of anthrax, Sep 2019, Bari, Italy. ⟨hal-02309307⟩
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