Minimum information specification for in situ hybridization and immunohistochemistry experiments (MISFISHIE) - CNRS - Centre national de la recherche scientifique Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Nature Biotechnology Année : 2008

Minimum information specification for in situ hybridization and immunohistochemistry experiments (MISFISHIE)

Eric Deutsch
Catherine Ball
  • Fonction : Auteur
Jules Berman
  • Fonction : Auteur
G Steven Bova
  • Fonction : Auteur
Roger Bumgarner
  • Fonction : Auteur
Helen Causton
  • Fonction : Auteur
Christian Christiansen
  • Fonction : Auteur
David Davidson
  • Fonction : Auteur
Young Ah Goo
  • Fonction : Auteur
Sean Grimmond
  • Fonction : Auteur
Thorsten Henrich
  • Fonction : Auteur
Bernhard Herrmann
  • Fonction : Auteur
John Johnson
  • Fonction : Auteur
Martin Korb
  • Fonction : Auteur
Asa Oudes
  • Fonction : Auteur
Helen Parkinson
  • Fonction : Auteur
Laura Pascal
  • Fonction : Auteur
John Quackenbush
Mirana Ramialison
  • Fonction : Auteur
Martin Ringwald
  • Fonction : Auteur
Christian Stoeckert
  • Fonction : Auteur
Jason Swedlow
  • Fonction : Auteur
Ronald Taylor
  • Fonction : Auteur
Laura Walashek
  • Fonction : Auteur
Anthony Warford
  • Fonction : Auteur
David S. Wilkinson
  • Fonction : Auteur
Yi Zhou
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 973537
Leonard I Zon
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 973559
Alvin Liu
  • Fonction : Auteur
Lawrence True
  • Fonction : Auteur

Résumé

One purpose of the biomedical literature is to report results in sufficient detail that the methods of data collection and analysis can be independently replicated and verified. Here we present reporting guidelines for gene expression localization experiments: the minimum information specification for in situ hybridization and immunohistochemistry experiments (MISFISHIE). MISFISHIE is modeled after the Minimum Information About a Microarray Experiment (MIAME) specification for microarray experiments. Both guidelines define what information should be reported without dictating a format for encoding that information. MISFISHIE describes six types of information to be provided for each experiment: experimental design, biomaterials and treatments, reporters, staining, imaging data and image characterizations. This specification has benefited the consortium within which it was developed and is expected to benefit the wider research community. We welcome feedback from the scientific community to help improve our proposal.
Fichier principal
Vignette du fichier
nihms-336668.pdf (478.91 Ko) Télécharger le fichier
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

hal-01780056 , version 1 (28-09-2023)

Identifiants

Citer

Eric Deutsch, Catherine Ball, Jules Berman, G Steven Bova, Alvis Brazma, et al.. Minimum information specification for in situ hybridization and immunohistochemistry experiments (MISFISHIE). Nature Biotechnology, 2008, 26 (3), pp.305 - 312. ⟨10.1038/nbt1391⟩. ⟨hal-01780056⟩
50 Consultations
5 Téléchargements

Altmetric

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More