WGS-based telomere length analysis in Dutch family trios implicates stronger maternal inheritance and a role for RRM1 gene - CNRS - Centre national de la recherche scientifique Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Scientific Reports Année : 2019

WGS-based telomere length analysis in Dutch family trios implicates stronger maternal inheritance and a role for RRM1 gene

Lilit Nersisyan , Maria Nikoghosyan (1) , Laurent C Francioli , Androniki Menelaou , Sara L Pulit , Clara C Elbers , Wigard P Kloosterman , Jessica van Setten , Isaäc J Nijman , Ivo Renkens , Paul I W de Bakker , Freerk van Dijk , Pieter B T Neerincx , Patrick Deelen , Alexandros Kanterakis , Martijn Dijkstra , Heorhiy Byelas , K Joeri van der Velde , Mathieu Platteel , Morris A Swertz , Cisca Wijmenga , Pier Francesco Palamara , Itsik Pe’er , Kai Ye , Kai Ye , Eric-Wubbo Lameijer , Matthijs H Moed , Marian Beekman , Anton J M de Craen , H Eka D Suchiman , P Eline Slagboom , Victor Guryev , Abdel Abdellaoui , Jouke Jan Hottenga , Mathijs Kattenberg , Gonneke Willemsen , Dorret I Boomsma , Elisabeth M van Leeuwen , Lennart C Karssen , Najaf Amin , Fernando Rivadeneira , Aaron Isaacs , Albert Hofman , André G Uitterlinden , Cornelia M van Duijn , Mannis van Oven , Manfred Kayser , Martijn Vermaat , Jeroen F J Laros , Johan T den Dunnen , David van Enckevort , Hailiang Mei , Mingkun Li , Mark Stoneking (2) , Barbera D C van Schaik , Jan Bot , Tobias Marschall , Alexander Schönhuth , Jayne Y Hehir-Kwa , Robert E Handsaker , Paz Polak , Mashaal Sohail , Dana Vuzman , Karol Estrada , Steven A Mccarroll , Shamil R Sunyaev , Fereydoun Hormozdiari , Vyacheslav Koval , Carolina Medina-Gomez , Ben Oostra , Jan H Veldink , Leonard H van den Berg , Steven J Pitts , Shobha Potluri , Purnima Sundar , David R Cox , Peter de Knijff , Qibin Li , Yingrui Li , Yuanping Du , Ruoyan Chen , Hongzhi Cao , Jun Wang , Ning Li , Sujie Cao , Jasper A Bovenberg , Gert-Jan B van Ommen , Arsen Arakelyan
Lilit Nersisyan
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Laurent C Francioli
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Androniki Menelaou
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Sara L Pulit
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Clara C Elbers
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Wigard P Kloosterman
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Jessica van Setten
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Isaäc J Nijman
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Ivo Renkens
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Paul I W de Bakker
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Freerk van Dijk
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Pieter B T Neerincx
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Patrick Deelen
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Alexandros Kanterakis
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Martijn Dijkstra
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Heorhiy Byelas
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K Joeri van der Velde
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Mathieu Platteel
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Morris A Swertz
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Cisca Wijmenga
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Pier Francesco Palamara
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Itsik Pe’er
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Kai Ye
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Kai Ye
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Eric-Wubbo Lameijer
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Matthijs H Moed
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Marian Beekman
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Anton J M de Craen
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H Eka D Suchiman
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P Eline Slagboom
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Abdel Abdellaoui
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Jouke Jan Hottenga
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Gonneke Willemsen
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Dorret I Boomsma
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Fernando Rivadeneira
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Jeroen F J Laros
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Johan T den Dunnen
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Alexander Schönhuth
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Jayne Y Hehir-Kwa
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Dana Vuzman
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Karol Estrada
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Steven A Mccarroll
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Shamil R Sunyaev
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Fereydoun Hormozdiari
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Ben Oostra
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Hongzhi Cao
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Jun Wang
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Ning Li
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Sujie Cao
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Jasper A Bovenberg
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Gert-Jan B van Ommen
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Arsen Arakelyan
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Résumé

Telomere length (TL) regulation is an important factor in ageing, reproduction and cancer development. Genetic, hereditary and environmental factors regulating TL are currently widely investigated, however, their relative contribution to TL variability is still understudied. We have used whole genome sequencing data of 250 family trios from the Genome of the Netherlands project to perform computational measurement of TL and a series of regression and genome-wide association analyses to reveal TL inheritance patterns and associated genetic factors. Our results confirm that TL is a largely heritable trait, primarily with mother’s, and, to a lesser extent, with father’s TL having the strongest influence on the offspring. In this cohort, mother’s, but not father’s age at conception was positively linked to offspring TL. Age-related TL attrition of 40 bp/year had relatively small influence on TL variability. Finally, we have identified TL-associated variations in ribonuclease reductase catalytic subunit M1 (RRM1 gene), which is known to regulate telomere maintenance in yeast. We also highlight the importance of multivariate approach and the limitations of existing tools for the analysis of TL as a polygenic heritable quantitative trait
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Lilit Nersisyan, Maria Nikoghosyan, Laurent C Francioli, Androniki Menelaou, Sara L Pulit, et al.. WGS-based telomere length analysis in Dutch family trios implicates stronger maternal inheritance and a role for RRM1 gene. Scientific Reports, 2019, 9, pp.18758. ⟨10.1038/s41598-019-55109-7⟩. ⟨hal-04604758⟩
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