Évolution du projet MetoTaxa (lauréat FNSO-2019), destiné à des revues en taxonomie, Metostem (lauréat FNSO-2021) se définit comme une chaîne de publication adaptée aux monographies dédiées aux STM. Ce projet vise à transformer les outils et les méthodes de production de l'ensemble des collections de monographies, jusqu'alors réalisées uniquement en version papier, afin de créer un modèle économique double, papier et numérique. Le fichier XML pivot sera enrichi dans un environnement d'édition structurée Métopes spécifique doté de dispositifs d'appel à des API vers des catalogues comme Zoobank, CrossRef ou encore GBIF et Treatment Bank avec GoldenGate (outil de la société Plazi), qui permet de structurer finement les taxons, les matériels examinés et les références bibliographiques. Metostem intégrera ainsi un maximum de données sémantisées et liées. Dès publication de l'imprimé, Metostem permettra la diffusion de versions numériques augmentées et détachables (ePub et pdf) ainsi qu'un accès freemium de la version HTML.

Metostem participera activement à la science ouverte et en conformité avec les principes « FAIR », en permettant de structurer et disséminer des contenus et des données issus de la recherche en biodiversité et écologie au sens large (inventaires, atlas, registres d'identification...), qui sont pour l'heure insuffisamment utilisés, faute d'accessibilité et d'interopérabilité.

Metostem mutualise les compétences propres à chaque partenaire : en tant qu'éditeur scientifique en taxonomie, biodiversité et écologie, le Muséum est chargé de la création du cahier des charges et la gestion du projet, qui porte sur trois collections pilotes (Faune et flore tropicales, Stratotypes et Patrimoines naturels) ; l'INIST apporte ses compétences techniques dans la structuration des contenus éditoriaux et l'export des fichiers finaux pour publication ; Métopes assure l'adaptation technique de l'outil de production selon les spécifications élaborées ensemble. Ce projet, commencé en avril 2022, s'achèvera en 2023 et pourra être étendu à d'autres éditeurs institutionnels.